Les enképhalines sont des pentapeptides, produits par l'organisme lors de stress oxydants, ils ont alors un rôle important dans les processus anti-douleur. Dans la méthionine enképhaline (Met-enk), les acides aminés Méthionine (Met), Tyrosine (Tyr) et Phénylalanine (Phe), sont les cibles principales des radicaux •OH générés lors de la radiolyse de l'eau.
Les premiers calculs en DFT des énergies libres (ΔG) de radicaux cations modèles de ces acides aminés isolés ont permis d'avoir une idée sur les mécanismes de compétition entre ces radicaux. Les calculs ont également confirmé que l'oxydation conduit à un radical cation Met•+, dont la densité de spin est localisée sur l'atome de soufre alors que celle-ci est délocalisée sur les noyaux aromatiques pour Tyr et Phe.
L'étape suivante a été l'étude de l'oxydation de Met-enk pour des structures très différentes, à l'aide de calculs QM/MM et de DFT contrainte [1]. Etant donné la grande flexibilité du pentapeptide, certaines conformations sont plus ou moins étendues et d'autres très repliées, avec des distances entre Met et Tyr de l'ordre de 4 Å. Ce qui a une répercussion sur les potentiels redox de (Met/Met•+) et de (Tyr/Tyr•+).
Les possibilités de Transferts Intramoléculaires d'Electrons entre Tyr et le radical cation Met•+, qui ont fait l'objet d'hypothèses expérimentales [2], ont alors été étudiés par des méthodes topologiques dépendant du temps telles que TD-RHO et TD-ELF associées à des calculs de chemins de transferts [3] et de densités de courant [4].
[1] de la Lande A., Salahub D.N. Theochem 2010 115, 943.
[2] Mozziconacci O. et al. 2012, J Phys Chem B 116:9352–9362
[3] de la Lande A.,et al.2010, Proc. Nat. Acad.Sci 107,11799-11804
[4] Hayashi T, Stuchebrukhov AA 2010, Proc Natl Acad Sci107:19157–19162
| Type : | : | affiche |
| Mots-Clés | : | DFT contrainte ; QM/MM ; solvatation ; potentiels redox ; TD ; RHO et TD ; ELF ; densité de courant |
| PDF version | : |  PDF version |
- Autre
